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                Ƣ迎讉K中国植物学会Q?/p>

                您所在的位置Q?a href="/index.aspx" title="|站首页">首页 >> 新闻中心 >> U研q展
                昆明植物所在植物线_体基因l替代速率异质性研I中取得重要q展
                日期Q?020-07-03 发布人: ??/a> ?/a> ?/a> 】?a onclick='javascript:window.print();' href="javascript:void(0);">打印 关闭?/span>

                 

                    遗传多样性演化是q化基因l核心问题之一。被子植物线_体基因l在大小、结构、基因及内含子数量等斚w均具有多h,q一特征使得U粒体基因组成ؓ研究基因l复杂性的理想pȝ。通常认ؓ植物U粒体基因组的进化速度较叶lF基因l、核基因l低Q且同一基因l内基因之间的进化速率较ؓ一致。但前期通过寚w分类如匍匐{骨草(Ajuga reptansQ线_体基因l的研究发现Q基因间同义F速率可相?个数量以上Q其演化路径与成因尚不清楚?nbsp;

                  
                    中国U学院昆明植物研I所植物多样性与基因l学团队朱安丹研I组和李德铢研究l立_安大科技基础设施中国西南野生生物U质资源库,对є形科QLamiaceaeQ筋骨草亚科QAjugoideaeQ全部四个主要分支中?个属19个种的线_体基因l进行了深入pȝ的分析,对线_体基因l中出现的替代速率异质性的发生旉和相兡x制进行了解析。研I发玎ͼ{骨草亚U线_体基因l中同义F速率Q?i>dSQ普遍高于非同义F速率Q?i>dNQ,且同一基因l内不同基因出现加速的旉不同Q有些基因的加速出现在{骨草亚U的核心cȝQcore AjugoideaeQ中Q如rps12{)Q有些出现在{骨草属及其姐妹属莸属等cȝ中(?i>atp6{)Q有些只出现在筋骨草属(AjugaQ中Q如ccmC{)Q但几种模式中替代速率都在{骨草属辑ֈ最大。进一步研I发玎ͼF速率变化最快的基因多数都位于基因簇上,而大部分q些基因在{骨草属和其姐妹属中都是新Ş成的Q新基因的形成要经历古老基因簇的断裂和新基因簇的融合,因此推测在这一q程中容易引入突变而导致基因突变速率提高。由于基因组的重l和基因转换会有一定的GC偏好性,因此通过对线_体蛋白~码基因的第三位密码子中GCQGC3Q含量的研究发现{骨草属中几乎所有快速进化基因的GC3水^都有显著提高QΡGC3含量的提高与dS显著相关。替代速率的提高还可能受到转录介导的修复或转录后修饰等因素的媄响,具体可以表现在RNA~辑位点的丢q斚wQ本研究通过l合转录l数据分析发现快速进化的基因丢失了所有祖先的RNA~辑位点Q而中速和低速进化的基因只丢׃量先的RNA~辑位点。该研究解析了植物线_体基因l替代速率多样性,推测了线_体基因l内同义F速率异质性生的机制Qؓ植物U粒体基因组复杂性演化的深入研究提供了理论支持?/span>

                  
                    该研I成果以“Episodic and GC-biased bursts of intragenomic and interspecific synonymous divergence in Ajugoideae (Lamiaceae) mitogenomes”为题q日在线发表于植物科学领域主杂?i>New Phytologist。中国科学院昆明植物研究所刘芳博士研究生和樊维姝博ؓ共同W一作者,李d铢研I员和朱安丹研究员ؓ共同通讯作者。昆明植物所分子生物学实验中心杨俊L正高U工E师、中U院东亚植物多样性与生物地理学重点实验室向春雷博、以及美国内拉斯加大学林肯分校Jeffrey Mower博士乨参与了该工作。该研究得到了中国科学院重大U技基础设施开攄I目(No. 2017-LSF-GBOWS-02Q、云南省基础研究计划Q?019FD055Q和U质库开N目的支持?/span>

                  
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                ?span style="margin: 0px; padding: 0px; border: 0px; list-style: none; outline: none; font-size: 10.5pt;">1 不同U粒体编码基因发生替代速率加速的旉不同 

                 

                ?span style="margin: 0px; padding: 0px; border: 0px; list-style: none; outline: none; font-size: 10.5pt;">2 基因F速率与基因簇?/span>GC3以及RNA~辑的关p?/span> 

                 

                 

                文章来源Q?中国U学院昆明植物研I所

                上一?遗传所李家z研I组在独脚金内酯信号转导机制研究中取得突破性进?/a>下一?植物所孔宏?徐桂霞团队在花器官n份基因与靶基因间的调控进化研I中取得重要q展

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                中国植物学会  京ICP?6026858?/p>

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